A 21. században járunk, mikor a technikai fejlődés észveszejtő sebességgel tágítja a lehetőségek körét, immár túl az emberin is. Az új lehetőségekkel azonban egészen új típusú bűntények jelennek meg. Vegyük mindjárt a titokzatos hackert, a "Kacagó Ember"-t, aki onnan kapta ezt a nevet, hogy évekkel ezelőtt elrabolt egy vállalati vezetőt, de hogy eltakarja saját arcát, digitálisan egy sematikus vigyorgó ábrát tett a feje elé. Hogy mi is volt a valódi célja, kezdetben homály fedi, mint ahogy azt is, miért tűnt el évekre és miért bukkant fel hirtelen újra. Olyan kor ez, ahol az emberek egyes testrészeiket - vagy akár egész testüket - géppel helyettesíthetik, illetve közvetlen agyi kapcsolatuk lehet az Internet felé. Vagy ott vannak a gondolkodó tankok, a Tachikomák, ezek a több fegyverrel is felszerelt, gyerekesen viselkedő és gyerekhangú pókszerű tankok, melyek képesek durva felületeken mászni, vagy fonalak segítségével függeszkedni, de akár láthatatlanná is álcázzák magukat, ha kell. A legelképesztőbb bűnesetek felderítésére létrehoztak egy különleges ügynökséget, a Kusanagi Motoko őrnagy vezette 9-es szekciót, melynek főnöke a csavaros eszű Aramaki, s tagjai Batou a néha viccelődő kemény legény, Togusa a családos helyszíni nyomozó, Ishikawa a háttérinformációk gyűjtője, Saito a mesterlövész, Boma a hallgatag robbantási szakértő, s a meglehetősen sötét Pazu. A sorozat 26 epizódja tehát az ő fordulatokkal és veszélyekkel teli, az emberi agy számára szinte felfoghatatlanul komplex munkájukat követi nyomon.